Baznīcas tornis tika uzcelts 1688. gadā būvju meistara Martina Knoha (Knoch) vadībā, bet 1862. gadā pēc Emīla Strausa (Strauss) projekta torni pārbūvē, paceļot to līdz 80,5 metru augstumam.
Sv. Trīsvienības baznīcai liktenīgs izrādījās II Pasaules karš, kura laikā Jelgavas pilsēta tika nopostīta. Lieli postījumi tika nodarīti arī Jelgavas Sv. Trīsvienības dievnamam. 1954. gadā baznīcas altāra daļu uzspridzina, ēkas mūrus novāc, atstājot zvanu torni, kas kļuva par militāru objektu.
2004. gadā torni pārsedza ar stikla jumtu, un tā augstums sasniedza 50,17 metrus, torņa formu saglabājot arhitekta M. Knoha veidotajā izskatā.
Piesaistot Eiropas Savienības finanšu līdzekļus, pēc vairāk kā 60 gadu klusēšanas, baznīcas tornis atdzima 2010. gada 16. novembrī un šobrīd priecē pilsētas iedzīvotājus un viesus kā vieta, kur atklāt daudz jauna un lieliski atpūsties.